築6年の木造2階建、屋根部分は陸屋根でシート防水仕様の住宅について相談させてください。

2階の部屋のちょうど部屋の角に部分、天井と壁の境目のクロスが黒ずんでいるのをみつけたので、天井を観察したところ、クロスが黒ずんでいる付近の天井（30cm×50cm）がよくみるとたわんでいます。
雨漏りだと思い、工事請負会社に連絡をし、近々確認をしてもらう予定です。
そこでご教示いただきたいのが、雨漏りだった場合、
雨漏りの原因が、排水ドレンの詰まり等であったとしても、
それを想定して、シート防水の下に防水シートを引いてあると思うので、
瑕疵担保責任による無償修理を要求できるものと考えているのですが、いかがなものでしょうか？

当方としては、雨漏り原因の除去と室内の変色した部分のクロス交換、
天井板の交換、断熱材の交換をしてほしいと思っています。